เด็กทารกที่เกิดจากการผ่าตัดคลอดมีแบคทีเรียจำนวนมาก

ทารกในช่องคลอดถูกแบคทีเรียกลืนเข้าไปทางช่องคลอด อย่างไรก็ตามจากการศึกษาขนาดใหญ่พบว่าเด็กทารกมีแบคทีเรียในช่องคลอดของแม่เพียงเล็กน้อยในความกล้าโดยไม่มีความแตกต่างระหว่างทารกที่เกิดทางช่องคลอดหรือโดยการผ่าตัดคลอด ในช่วงแรกเกิดทารกจะสัมผัสกับแบคทีเรียจากลำไส้ของแม่ การศึกษาพบว่ามันเป็นแบคทีเรียในลำไส้ของแม่

ที่ทำขึ้นจากมากในทารกที่คลอดทางช่องคลอด ทารกที่เกิดจากการผ่าตัดคลอดมีแบคทีเรียเหล่านี้น้อยกว่ามาก การศึกษาครั้งนี้จึงไม่พบหลักฐานใด ๆ ที่สนับสนุนการโต้เถียงการใช้อวัยวะเพศในช่องคลอด ซึ่งอาจถ่ายโอนแบคทีเรียอันตรายให้กับทารกแทนที่แม่ของแบคทีเรียบางส่วนเด็กทารกที่เกิดจากการผ่าตัดคลอดมีแบคทีเรียจำนวนมากที่มักจะได้รับในโรงพยาบาลและมีแนวโน้มที่จะมีความต้านทานยาต้านจุลชีพ นักวิจัยได้ทำการแยกเติบโตและจัดลำดับจีโนมของแบคทีเรียที่ทำให้เกิดโรคเหล่านี้มากกว่า 800 ตัวยืนยันว่าพวกมันเหมือนกับสายพันธุ์ที่ทำให้เกิดการติดเชื้อในกระแสเลือดในโรงพยาบาลในสหราชอาณาจักร แม้ว่าแบคทีเรียเหล่านี้มักจะไม่ก่อให้เกิดโรคในลำไส้ แต่ก็สามารถทำให้เกิดการติดเชื้อได้หากเข้าที่ผิดหรือระบบภูมิคุ้มกันล้มเหลว